去年莫拉克颱風造成高屏溪水系淤積大量土石，經濟部水利署第七河川局經過1年大規模持續疏濬，包括在高雄縣旗山溪、荖濃溪，屏東縣隘寮溪、武洛溪等重要河川，結合國軍與高雄縣、屏東縣政府加快進行疏濬，至今疏濬土石已超過2300萬立方公尺，相當於清運超過11棟台北101大樓的土砂，更是往年疏濬量的5倍。
此外，七河局積極加快高雄縣旗山鎮河段疏濬部份，目前完成土石疏濬量，已超過350萬立方公尺，疏濬後大幅增加通水面積，預估水位局部最大下降更達2.25公尺，減少旗山鎮洪水溢堤再度發生，預計今年年底前將可完成疏濬量500萬立方公尺。
莫拉克颱風後，經濟部水利署第七河川局立即在旗山溪旗山鎮河段、荖濃溪新威大橋、隘寮溪南華大橋等河段進行緊急疏濬，去年10月底前，就先完成多達60萬立方公尺土石疏濬，避免洪水造成二次災害。
此外，高雄縣政府、屏東縣政府與國軍協助進行疏濬，總完成疏濬量為往年5倍，疏濬總進度更超前達145%，提前達成經濟部水利署於莫拉克災後重建，辦理「加強河川野溪及水庫疏濬方案」，行政院吳敦義院長指示於今年6月30日前完成6500萬方土石疏濬量，進度已提前於今年5月19日完成。
未來第七河川局將以無上限目標持續辦理疏濬，為防止洪水漫流與避免二次災害發生，將持續重新檢視急要瓶頸河段與影響公共設施、部(村)落居住安全河段，持續增辦疏濬或疏通工程；另採開口合約方式，必要時執行緊急疏通，作好相關防汛準備與應變作業，以維護河防安全，避免民眾生命與財產再受到威脅。
由於短期大量疏濬土石，第七河川局加速土石儲備中心（土方銀行）建置作業，發揮調節土石供需功能；現有高雄縣旗山鎮土石儲備中心，七河局另在屏東縣九如鄉九如堤防、里港鄉土庫堤防、高樹鄉關福堤防與高雄縣六龜鄉二坡堤防，將規劃土石儲備中心，目標預計儲備800~1000萬立方公尺土石，以達疏濬減災、儲備資源與興利建設等多重效益。
七河局表示，莫拉克風災後已盡全力執行疏濬，但因淤積量實在太大，無法一時全部清除，未來5年，七河局疏濬腳步將持續，達到維護河防安全。同時也呼籲民眾，如政府發布災害預警通報，請民眾配合政府撤離作業避災，降低生命與財產損失。