經濟部水利署易淹水特別預算成立之「將軍溪排水系統治理工程（華宗橋至箍寮橋整治工程）及（箍寮橋至將軍橋整治工程）」兩件工程，將於96年11月24日申報開工，施工工期540日，預定98年5月16日完工，往年造成將軍、北門、學甲地區村落嚴重浸水災害情形，施工後將可獲得明顯改善。
將軍溪排水幹線全長約11公里，本排水因尚未整治及排水斷面不足，每逢豪雨或颱風即淹水，復因94年612豪雨暨海棠颱風侵襲，造成沿岸鄉鎮嚴重水災，影響民生甚鉅。在地方財政拮据情形下，卻始終無法加以整治，為利治理本河段已於93年由水利規劃試驗所辦理完成規劃，再納入「易淹水地區水患治理計畫」第一階段辦理整治。將軍溪原屬台南縣管河川，相關計畫書公聽會、用地分割、查估及取得由台南縣政府主政辦理，次由經濟部水利署第七河川局依規劃之河寬、坡度、計畫流量等辦理設計及監造。為加速整治，工程分將軍溪排水系統治理工程（華宗橋至箍寮橋整治工程）及（箍寮橋至將軍橋整治工程）二件，已完成發包作業，將興建由將軍溪華宗橋往下游至將軍溪橋約4,688公尺長護岸，工程中之箍寮橋因跨度不足，亦已由台南縣政府設計發包中。完工後可減少沿岸鄉鎮淹水損失，保障沿岸居民生命財產安全。本河段係以土方平衡施作土堤之生態工程，並增加多孔隙材料復育河岸生態，以營造可休憩之自然環境，讓當地居民多一處休閒遊憩空間。
本工程用地取得部份已於96年11月14日公告，預計於12月底前完成發放。為利工程之早日完成，惠請工程區域內之土地所有人屆時配合工程施作搬遷，將使97年汛期前可施作達一定之保護程度。