東港溪為蜿蜒之平原河川，各河段河川形態不同，上游段為辮狀流形態，中游段彎曲蜿延，下游段微彎略平直，有豐富的水資源，提供高雄地區工業用水。
　　東港溪下游為感潮河段，配合大鵬灣風景區及東港鮪魚季，營造休閒及發展水上活動之觀光景點，東港溪流域中上游，水質污染輕度，河道內有高灘地、濕地分 佈，為水中生物，及鳥類之重要棲息地，是本流域生物生態資源最豐河段，其中以萬安橋至潮州大橋之間區域，保有南部僅存之河川田野平原、生態資源、生活文物 等美質景觀文化區域。防洪工程除洪泛區管制外，臨村落附近採近自然工法施設護岸保護，故東港溪既為河川教育宣導素材，更為觀光旅遊去處。
　　東港溪現有流路大部分流經私有地，致所需用地徵收經費龐大，為整治東港溪遭逢之最大困難，經本局極力爭取奉行政院經建會核定東港溪下游段治理工程實施計畫，已逐年編列預算辦理堤防興建。